В 2008 г. защитил кандидатскую диссертацию по теме «Геоэкологические особенности структуры донных природных комплексов северной части Каспийского моря», ученая степень кандидата географических наук по специальности 25.00.36 – «Геоэкология» присвоена в 2009 г.

Б.М. Малашенков развивает направление, связанное с исследованием процессов стабильности и изменчивости донных природных комплексов и проблемой восстановления деградированных морских экосистем крупных внутренних водоемов. Ряд статей посвящен разработке методических подходов к оценке природно-ресурсного потенциала подводных ландшафтов. В течение последних лет занимается изучением последствий разработки нефтегазодобывающих структур на морском шельфе, вопросами физико-географической классификации и ландшафтного районирования южных морей. В настоящее время в сферу его научных интересов входит изучение экологических последствий антропогенного воздействия на северный регион Каспийского моря (методы экологических исследований, мониторинг, ресурсный потенциал). 

• Экологическая политика
• Основы управления отраслями национальной экономики
• Безопасность жизнедеятельности
• Экономическая география и пространственная экономика в нефтегазовой отрасли

• Гидроэкология
• Геоэкология
• Устойчивое развитие
• Ландшафтоведение
• Охрана вод
• Экономическая география мира и России

• Разработка методических подходов к оценке природно-ресурсного потенциала подводных ландшафтов
• Изучение динамики донных природных комплексов внутренних морей